集団遺伝学の基礎について，授業の復習をメインにまとめてみます． 「適応進化遺伝学」テキストを参考にしています． 自分の学習用ですので，間違いなどあるかもしれません． 遺伝的浮動集団の大きさが有限であれば，偶然の効果によるゆらぎの影響力が無視で…

集団遺伝学の基礎について，授業の復習をメインにまとめてみます． 「適応進化遺伝学」テキストを参考にしています． 自分の学習用ですので，間違いなどあるかもしれません． 遺伝的変異用語遺伝的変異 (genetic variation): 集団内で遺伝子に多様性があるこ…

近似ベイズ計算 (ABC: Approximate Bayesian Computation) に基づいたパラメータ推定のできるパッケージabcを紹介します．ABCとはABCは，尤度関数の計算が不可能・困難なときに，尤度関数を求めることなく事後分布を推定できる手法です．比較的新しい手法で…

カテゴリカル変数を目的変数にとったロジスティック回帰分析についてまとめてみます． 主に『カテゴリカルデータ解析 (Rで学ぶデータサイエンス 1)』 藤井良宜 2010年 共立出版 の第6章を参考にしました．ロジスティック回帰分析とはカテゴリカル変数として…

Rのループを (しかたなく) 使うときに． このあたりのエントリを参考にしました． Another aspect of speeding up loops in R (me nugget) How to speed up loops in R (Revolutions) 例1のように，まわすたびにオブジェクトのサイズが変わっていくようなル…